基于麥冬轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的SSR序列特征分析及引物設(shè)計(jì)
摘要: 采用高通量測序技術(shù)獲得了麥冬轉(zhuǎn)錄組53 466條Unigenes,并通過序列分析識別出35 832個(gè)SSR位點(diǎn),分布于24 539條Unigenes上,SSR出現(xiàn)頻率高達(dá)67.02%,平均分布距離為4.88 kb。對包含SSR位點(diǎn)的24 539條Unigenes進(jìn)行GO和KEGG注釋,結(jié)果顯示主要集中于生物學(xué)過程、植物-病原體互作等基因功能和代謝通路。從SSR重復(fù)基元類型來看,... (共9頁)
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