基于液相芯片“黃海芯1號(hào)”55K SNP信息開展凡納濱對蝦收獲體重的ssGWAS和FarmCPU分析
摘要: 為鑒定出與凡納濱對蝦生長性狀相關(guān)的SNP位點(diǎn)和功能基因,本研究針對來自具有快速生長特性的選育和引進(jìn)品系共74個(gè)家系進(jìn)行生長和存活測試,利用液相芯片“黃海芯1號(hào)”(55K SNP)對其中39個(gè)家系個(gè)體進(jìn)行高通量基因分型,通過ssGBLUP方法估計(jì)了體重性狀的基因組遺傳參數(shù),并首次利用ssGWAS和FarmCPU方法解析了可能與其關(guān)聯(lián)的SNP位點(diǎn)及功能基因。遺傳參數(shù)估計(jì)結(jié)果顯示,收... (共11頁)
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