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依據(jù)云南栘[木衣]種子萌發(fā)至成苗期間轉(zhuǎn)錄組的SSR、SNP及InDel特征

東北林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào) 頁(yè)數(shù)： 7 2024-12-27
摘要： 依據(jù)云南栘[木衣](Docynia delavayi(Franch.) Schneid.)種子萌發(fā)至成苗期間的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，分別使用MISA、GATK3軟件對(duì)SSR、SNP、InDel位點(diǎn)進(jìn)行挖掘并進(jìn)行特征分析。結(jié)果表明：從轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的63 782個(gè)非冗余基因序列(unigene)中，共挖掘出76 981個(gè)SSR位點(diǎn)，其發(fā)生頻率為30.18%。在各種不同的重復(fù)基元種類(lèi)里，重復(fù)出現(xiàn)... （共7頁(yè)）

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