固定骨架的從頭蛋白質(zhì)設(shè)計:多目標(biāo)優(yōu)化與深度學(xué)習(xí)算法研究進(jìn)展
摘要: 固定骨架的蛋白質(zhì)設(shè)計通過計算的方法生成能夠折疊為目標(biāo)蛋白結(jié)構(gòu)的氨基酸序列,該過程可以被視作蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測的逆過程.蛋白質(zhì)的功能與結(jié)構(gòu)有著緊密的聯(lián)系,因此基于特定結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)設(shè)計在酶、疫苗、制藥、蛋白質(zhì)材料等領(lǐng)域都有著潛在的作用.基于蛋白質(zhì)設(shè)計的方法原則,根據(jù)當(dāng)前該領(lǐng)域的進(jìn)展討論了基于能量函數(shù)優(yōu)化和基于深度學(xué)習(xí)這兩種主要的蛋白質(zhì)設(shè)計算法類型,最后總結(jié)當(dāng)前蛋白質(zhì)設(shè)計領(lǐng)域的瓶頸問題并... (共7頁)
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