河八王轉(zhuǎn)錄組SSR和SNP序列特征及系統(tǒng)發(fā)育分析

摘要： 【目的】對甘蔗野生種河八王轉(zhuǎn)錄組SSR和SNP序列特征及系統(tǒng)發(fā)育進行分析，為深入研究甘蔗屬植物分子標(biāo)記開發(fā)、種質(zhì)資源利用、種群遺傳結(jié)構(gòu)和分化歷史動態(tài)提供參考。【方法】基于河八王轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，利用MISA和SOAPsnp軟件對獲得的Unigenes進行SSR和SNP位點發(fā)掘及序列特征分析，并從JGI數(shù)據(jù)庫下載二穗短柄草、水稻、谷子、高粱、玉米物和擬南芥轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，采用最大似然（ML... （共10頁）