不同產(chǎn)地忽地笑的葉綠體基因psb A-trn H序列分析

摘要： 目的通過葉綠體基因psb A-trn H序列分析,探討我國忽地笑種質(zhì)資源的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系及分子鑒定方法。方法分別提取15省(市)52個(gè)忽地笑居群的DNA,經(jīng)PCR擴(kuò)增葉綠體基因psb A-trn H序列及測序,并用Mega5.0等軟件對(duì)測序結(jié)果進(jìn)行分析。結(jié)果 52條psb A-trn H序列長度為544～656 bp,GC含量為35.8%～37.0%,遺傳距離為0.000 00～0.009 47;核苷酸變異(多態(tài)性)位點(diǎn)數(shù)共33個(gè),其中簡約信息位點(diǎn)9個(gè),單一突變位點(diǎn)18個(gè),插入/缺失片段6個(gè);單倍型數(shù)量(H)10個(gè),單倍型多態(tài)性水平(Hd)0.749,核苷酸多態(tài)性(π)0.002 63,收集的忽地笑資源具有較高的遺傳多樣性。最大簡約法(maximum parsimony,MP)系統(tǒng)樹中52個(gè)居群聚為4類,并且該聚類結(jié)果與其地理分布基本一致。結(jié)論不同產(chǎn)地忽地笑居群的遺傳變異較大,psb A-trn H序列可作為忽地笑種源分子鑒定的依據(jù);我國忽地笑種質(zhì)資源在進(jìn)化上具有明顯的地域性特征。 （共11頁）