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怒江大峽谷怒江州段土壤放線菌多樣性

微生物學(xué)通報 頁數(shù): 16 2017-11-08 10:48
摘要: 【背景】怒江大峽谷怒江州段憑借獨特的地理環(huán)境、豐富的動植物多樣性以及極少的人為干擾,擁有很高的生物多樣性調(diào)查價值,但對于該生境中的放線菌多樣性研究尚未見相關(guān)報道。【目的】研究怒江大峽谷怒江州段土壤放線菌多樣性情況。【方法】利用Illumina Hi Seq平臺對怒江州段土壤樣品放線菌免培養(yǎng)多樣性進行高通量測序,通過相對豐度、物種聚類、主成分分析對不同樣品中放線菌組成及其相似性進行了分析。同時通過9種不同類型培養(yǎng)基結(jié)合有效的預(yù)處理方法和非目的菌抑制劑進行放線菌的純培養(yǎng)分離?!窘Y(jié)果】高通量測序共獲得Tag數(shù)目474 203條,OTU數(shù)目15 671個,它們分布于細(xì)菌域下的47個門90個綱170個目320個科561個屬。通過不同樣品的比較,發(fā)現(xiàn)BS、F-G、F-L、L樣品的放線菌免培養(yǎng)多樣性普遍優(yōu)于丙中洛樣點的BB、BT、BH樣品。純培養(yǎng)分離共獲得351株放線菌,分布于放線菌綱下8個目14個科26個屬。所用9種培養(yǎng)基中,YIM171培養(yǎng)基的分離效果最好。通過比較不同樣品的放線菌純培養(yǎng)多樣性,丙中洛混合樣明顯優(yōu)于其他樣品?!窘Y(jié)論】怒江大峽谷怒江州段土壤樣品中放線菌多樣性豐富,應(yīng)進一步挖掘其放線菌資源潛力,為今后放線菌次生代謝產(chǎn)物的開發(fā)提供有效的菌株資源。 (共16頁)

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