山羊瘤胃甲烷菌第七目菌株的富集、可利用底物及其主要共生菌的分析
摘要: 在瘤胃中,甲烷菌第七目Methanomassiliicoccales(Mmc)是僅次于甲烷桿菌目的第二大菌群。Mmc菌株較難分離純化,且尚未建立完善的系統(tǒng)進(jìn)化分類體系。本文利用甲烷菌與產(chǎn)氫纖維降解細(xì)菌共分離的方法,富集純化山羊瘤胃Mmc菌株,揭示其底物利用特性及共生細(xì)菌多樣性。16S r RNA基因和mcr A基因鑒定結(jié)果顯示:細(xì)菌培養(yǎng)液中僅含有一種Mmc甲烷菌J3。系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示J3屬于Mmc的"Ca.M.alvus"簇,與Candidatus Methanogranum caenicola相似性最高(96%)。與J3共生的細(xì)菌主要有Pyramidobacter piscolens(54.5%)、unclassified Ruminococcaceae(21.3%)、Blautia producta(14.8%)、Atopobium sp.(4.9%)、Eubacterium sp.(1.5%)。體外發(fā)酵結(jié)果顯示,J3不但能夠利用三甲胺,還能夠利用甲醇。結(jié)論,與細(xì)菌共分離的方法能夠在短期內(nèi)從瘤胃液中富集純化到Mmc甲烷菌。 (共6頁)
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