海南粗榧GGPPs基因克隆與誘導(dǎo)表達分析
摘要: 瀕危植物海南粗榧富含多種抗癌活性次生代謝產(chǎn)物。為研究這些產(chǎn)物的生物代謝途徑和表達調(diào)控,通過同源克隆和RACE技術(shù)獲得了海南粗榧紫杉醇生物合成途徑中通用前體牻牛兒基牻牛兒焦磷酸合成酶(GGPPs)基因全長并進行了生物信息學(xué)分析。該基因命名為CmGGPPs(GenBank登錄號:JX971119),并進一步利用不同激發(fā)子誘導(dǎo)研究了該基因?qū)Σ煌婢承盘柕捻憫?yīng)情況。結(jié)果表明:海南粗榧GGPPs基因cDNA全長1694bp,包含一個1182bp的ORF框,編碼393個氨基酸;預(yù)測該基因編碼蛋白質(zhì)分子量為42.91kD,其等電位為7.12。通過BLAST比對結(jié)果分析,海南粗榧GGPPs基因全長核苷酸序列與紅豆杉科植物的同源性最高可達91%,氨基酸序列有89%的相似性。同時,GGPPs基因氨基酸序列同其他植物也有較高的同源性。用不同類型激發(fā)子處理發(fā)現(xiàn),GGPPs在誘導(dǎo)后表達量均上升,但不同激發(fā)子誘導(dǎo)的基因表達強度和速率存在明顯區(qū)別。 (共7頁)
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