16S rRNA基因測序分析技術(shù)在食品污染菌監(jiān)測中的應(yīng)用

摘要： 目的將16S rRNA基因測序分析技術(shù)應(yīng)用于食品安全風(fēng)險監(jiān)測中非目標(biāo)(相似、少見或非典型)致病菌的鑒定,為食源性疾病防控提供更多病原學(xué)證據(jù)。方法采集18份畜類、18份禽類和9份魚類共45份生鮮樣品,目標(biāo)致病菌按照GB4789標(biāo)準(zhǔn)檢測,非目標(biāo)菌進(jìn)行16S rRNA基因測序,將全長序列在GenBank中比對確定細(xì)菌種屬,通過MEGA6構(gòu)建細(xì)菌16S rRNA基因進(jìn)化樹,判定細(xì)菌種屬間的親緣關(guān)系。結(jié)果 45份生鮮樣品中檢出19株目標(biāo)致病菌,包括沙門氏菌、空腸彎曲菌、單增李斯特菌和副溶血弧菌,而34株非目標(biāo)菌16S rRNA基因全長序列能分別比對出13種細(xì)菌,其中8種19株菌屬于致病或條件致病菌,包括霍亂弧菌、溶藻弧菌、結(jié)腸彎曲菌、奇異變形桿菌、糞腸球菌和銅綠假單胞菌,以及在深圳乃至省內(nèi)首次報道的布氏弓形菌和海藻希瓦氏菌。結(jié)論深圳市售生鮮食品受到多種食源性致病菌污染,特別是非目標(biāo)檢出的致病菌,對此認(rèn)為16S rRNA基因測序分析技術(shù)是一套有效的細(xì)菌監(jiān)測適宜技術(shù),能提高食源性疾病和食物中毒的防控水平。 ... （共5頁）