擴增子與宏基因組策略在猴痘病毒全基因組測序考核中的應用比較
摘要: 目的 比較擴增子與宏基因組測序在猴痘病毒全基因組測序考核中的應用效果,為猴痘病毒測序溯源與疫情防控提供技術參考。方法 擴增子測序:對猴痘DNA先進行全基因組靶向擴增,再對擴增產物進行二代測序;宏基因組測序:對猴痘DNA直接進行二代測序。獲得序列后使用CLC、IGV等軟件分析2種不同測序方法的有效數(shù)據(jù)百分比、測序深度及不同測序深度下的病毒全基因組測序覆蓋度等質量參數(shù),評估測序質量... ...
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