羊口瘡病毒安徽株VIR基因克隆與生物信息學(xué)分析
摘要: 目的獲取并分析ORFV AH-F10株VIR基因序列及預(yù)測(cè)其編碼蛋白的生物信息學(xué)特點(diǎn)。方法利用實(shí)驗(yàn)室保存的羊口瘡AH-F10株,設(shè)計(jì)VIR基因引物并進(jìn)行PCR擴(kuò)增、克隆及序列測(cè)定,同時(shí)利用生物信息學(xué)方法對(duì)其編碼的蛋白的理化性質(zhì)、二級(jí)結(jié)構(gòu)、三級(jí)結(jié)構(gòu)、信號(hào)肽、磷酸化位點(diǎn)、跨膜結(jié)構(gòu)域以及線性細(xì)胞表位進(jìn)行預(yù)測(cè)。結(jié)果 AH-F10-VIR基因長(zhǎng)552bp,編碼183個(gè)氨基酸,與Nanto... ...
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